上海市質(zhì)子重離子臨床技術研發(fā)中心（以下簡稱“研發(fā)中心”）于2014年1月設立，與上海市質(zhì)子重離子醫(yī)院（以下簡稱“醫(yī)院”）實行“一體化”管理，是一所集臨床治療、研究及新技術研發(fā)于一身，以國際尖端腫瘤放射治療技術-質(zhì)子重離子放射治療技術為主要治療手段的現(xiàn)代化、國際化腫瘤中心。研發(fā)中心、醫(yī)院地處上海市浦東新區(qū)張江科學城內(nèi)，占地150畝，核定床位220張，擁有目前世界上最先進的質(zhì)子重離子放射治療系統(tǒng)，可為廣大患者提供優(yōu)質(zhì)的腫瘤治療服務。
上海市質(zhì)子重離子醫(yī)院是一所集醫(yī)療、科研、教學于一身，以國際尖端腫瘤放射治療技術——質(zhì)子重離子放射治療技術為主要治療手段的現(xiàn)代化、國際化腫瘤中心，也是國內(nèi)首家同時擁有質(zhì)子和重離子放射治療技術的醫(yī)療機構。醫(yī)院由上海申康醫(yī)院發(fā)展中心建設，通過與復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院高度融合、資源共享開展實際臨床運營，為廣大患者提供優(yōu)質(zhì)的腫瘤診療和早期腫瘤篩查服務。
上海市質(zhì)子重離子醫(yī)院于上世紀90年代開始籌備，2003年項目正式啟動。在中央領導關心和國家有關部委支持下，上海“十年磨一劍”成功建成國內(nèi)第一家質(zhì)子重離子醫(yī)院。2014年，醫(yī)院順利開展35例臨床患者試驗。2015年5月8日，醫(yī)院正式開業(yè)。2017年9月，醫(yī)院通過國際醫(yī)療機構評審聯(lián)合委員會認證，成為全球范圍內(nèi)第一家通過JCI認證的質(zhì)子重離子中心。2020年1月，醫(yī)院掛牌成為復旦大學附屬質(zhì)子重離子醫(yī)院。
醫(yī)院地處上海市浦東新區(qū)張江科學城，總占地面積150畝，一期總建筑面積52，542平方米，核定床位220張，門診診室24間。醫(yī)院引進的質(zhì)子重離子系統(tǒng)設備可以引出質(zhì)子和重離子兩種射線，并且配備了國際先進的筆形掃描技術、呼吸門控技術和滑軌CT設備等。
開業(yè)八年來，醫(yī)院不斷優(yōu)化診療流程、提升診療效率，截至2023年5月8日，累計治療出院患者5648例，年平均增長率達20％。其中，2022年，醫(yī)院年度治療量再次突破千例大關，達到1025例，創(chuàng)開業(yè)以來新高并居全球同類質(zhì)子重離子放療機構之首。醫(yī)院以患者需求為導向，突出重離子技術優(yōu)勢，將國內(nèi)發(fā)病率靠前的鼻咽癌、顱內(nèi)顱底腫瘤、肺癌、肝癌、前列腺癌等5個病種作為臨床重點病種，將胰腺癌、乳腺癌作為臨床研究病種，這7個病種（5+2）的出院患者數(shù)占總數(shù)的四分之三。
醫(yī)院重離子治療復發(fā)鼻咽癌、肺小結節(jié)肺癌等實現(xiàn)了國際放療領域“零的突破”，自主創(chuàng)新形成的66項粒子診療“中國方案”，打破了發(fā)達國家“話語權”的壟斷。醫(yī)院開業(yè)以來，完成了從粒子技術應用的學習者、追趕者，到躋身國際粒子治療先進行列，并在重離子技術臨床應用創(chuàng)新領域漸成領跑者。