云南省第三人民醫(yī)院始建于1950年，前身為昆明鐵路局中心醫(yī)院。2004年4月整體移交原省衛(wèi)生廳管理，更名為省第三人民醫(yī)院，2008年掛牌為大理大學(xué)昆明附屬醫(yī)院，2010年被確定為云南省省級公立醫(yī)院綜合改革試點(diǎn)單位，2017年加掛成為云南省職業(yè)病醫(yī)院。目前是昆明市官渡區(qū)唯一一所集醫(yī)療、教學(xué)、科研、健康管理、職業(yè)病診治為一體的省級三級甲等綜合醫(yī)院。
醫(yī)院占地43畝，業(yè)務(wù)用房4萬平方米。編制床位1200張，內(nèi)設(shè)34個臨床科室、8個醫(yī)技科室、25個職能部門和5個社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心（站）。
醫(yī)院擁有1個院士實(shí)驗(yàn)室：周宏灝院士精準(zhǔn)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室；孫道遠(yuǎn)、竇祖林等多個專家工作站；1個省級研究中心：職業(yè)中毒救治臨床診療研究中心；5個省級中心：云南省職業(yè)中毒救治中心、云南省企業(yè)職工體檢中心、云南省臨床營養(yǎng)質(zhì)量控制中心、云南省職業(yè)病診療質(zhì)控中心、云南省疼痛醫(yī)療質(zhì)量控制中心；9個培訓(xùn)基地：國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地、國家級臨床藥師培訓(xùn)基地、國家級?？浦a(chǎn)士臨床培訓(xùn)基地、中華醫(yī)學(xué)會疼痛學(xué)分會臨床培訓(xùn)基地、中國康復(fù)醫(yī)學(xué)會吞咽障礙康復(fù)?？婆嘤?xùn)基地、云南省婦科內(nèi)鏡診療技術(shù)培訓(xùn)基地、云南省限制類醫(yī)療技術(shù)臨床應(yīng)用規(guī)范化培訓(xùn)基地、云南省職業(yè)中毒救治培訓(xùn)基地、云南省盆底超聲培訓(xùn)基地；1個國家級臨床重點(diǎn)?？疲豪夏赆t(yī)學(xué)科；12個省級臨床重點(diǎn)?？疲簨D科、產(chǎn)科、肝膽胰外科、普外科、骨科、疼痛科、麻醉科、消化內(nèi)科、內(nèi)分泌科、康復(fù)醫(yī)學(xué)科、放射醫(yī)學(xué)影像科、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)科；2個省院共建項(xiàng)目：職業(yè)病檢測中心、血液凈化科；2個省院培育項(xiàng)目：內(nèi)分泌科、婦產(chǎn)科。
全院在職職工1449人，其中專業(yè)技術(shù)人員1263人，占職工總數(shù)的91％，高級職稱人員占18.7％，中級職稱占32.7％，碩博士占17.3％，碩士研究生導(dǎo)師55名，擁有領(lǐng)軍人才、優(yōu)秀學(xué)科帶頭人等各類人才。
醫(yī)院設(shè)有內(nèi)、外、婦、兒、醫(yī)技、護(hù)理六個教研室和一個中心實(shí)驗(yàn)室，7個專業(yè)取得住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地資格，擁有齊全的教學(xué)設(shè)施和科研設(shè)施。醫(yī)院與泰國清邁大學(xué)、上海市肺科醫(yī)院、上海市第十人民醫(yī)院建立了長期合作關(guān)系，與全省多家醫(yī)療機(jī)構(gòu)建立聯(lián)盟醫(yī)院合作，是國際應(yīng)急管理學(xué)會醫(yī)學(xué)委員會的合作單位。
醫(yī)院參與了“5.12汶川地震”“4.14玉樹地震”“3.01昆明暴恐事件”“8.03魯?shù)榈卣稹钡韧话l(fā)公共事件的救災(zāi)、應(yīng)急處置工作，受到各級政府和人民群眾的好評。先后榮獲“全國抗震救災(zāi)英雄集體”“全國百姓放心醫(yī)院”“國家級節(jié)約型公共機(jī)構(gòu)示范單位”“全國模范職工之家”“全國先進(jìn)工會組織”“全國醫(yī)院文化建設(shè)先進(jìn)單位”“云南省醫(yī)德醫(yī)風(fēng)示范醫(yī)院”“云南省優(yōu)質(zhì)護(hù)理服務(wù)示范工程先進(jìn)單位”“云南省省級消防安全示范單位”“昆明市餐飲服務(wù)食品安全A級單位”和“昆明市園林單位”等榮譽(yù)稱號。