2002年2月，石景山區(qū)疾病預(yù)防控制中心正式組建成立。擁有有職工105，檢驗(yàn)檢測儀器67臺(tái)，可開展各類檢驗(yàn)檢測170余項(xiàng)。
中心在經(jīng)歷抗擊“非典”的考驗(yàn)和鍛煉后，進(jìn)一步加強(qiáng)公共衛(wèi)生職能建設(shè)，在信息化建設(shè)、監(jiān)測檢驗(yàn)、應(yīng)急事件預(yù)警與處置、健康教育、人員培訓(xùn)等方面進(jìn)行有計(jì)劃投入，疾病預(yù)防控制綜合能力有了顯著提高。正另址籌建新的業(yè)務(wù)大樓。中心獲得國家計(jì)量認(rèn)證合格證書；通過職業(yè)健康檢查和職業(yè)病危害因素檢測與評(píng)價(jià)資質(zhì)評(píng)審；連續(xù)七年獲得首都文明單位的光榮稱號(hào)。
2020年4月，被列入北京市面向團(tuán)體提供新冠病毒核酸檢測服務(wù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)名單。