山東省疾病預防控制中心前身是1949年3月成立的山東醫(yī)療防疫大隊，1953年組建山東省衛(wèi)生防疫站。為適應疾病預防控制體制改革的需要，2003年1月，在原山東省衛(wèi)生防疫站基礎上正式成立山東省疾病預防控制中心。隨著職能和服務范圍不斷拓展，中心還正式加掛了山東省預防醫(yī)學科學院、山東省食品安全風險評估中心、山東省衛(wèi)生檢測檢驗中心、山東省艾滋病預防控制中心、山東第一醫(yī)科大學公共衛(wèi)生與健康管理學院等牌子。承擔疾病預防與控制、突發(fā)公共衛(wèi)生事件和災害應急處置、疫情及健康相關(guān)因素信息管理、疾病和傳染病預防控制技術(shù)指導與應用研究推廣、健康危害因素監(jiān)測與干預、健康教育與健康促進、疾病和傳染病病原生物檢測和物理化學因子檢測評價等職能，是實施政府公共衛(wèi)生職能的核心專業(yè)機構(gòu)、全省食品安全風險監(jiān)測核心技術(shù)機構(gòu)、全省疾病預防控制工作的技術(shù)指導中心。
中心目前核定編制513人?，F(xiàn)有泰山學者特聘專家2名、泰山學者青年專家3名、享受國務院政府特殊津貼專家3名、國家衛(wèi)生健康委有突出貢獻的中青年專家2名、世界衛(wèi)生組織西太區(qū)消除麻疹證實委員會委員1名，聘任首席專家6名?，F(xiàn)有辦公用房2.6萬平方米，實驗室用房2.5萬平方米，位于濟南市東部生命科學城發(fā)展中心的新址建設正在全面推進，總建筑面積20萬平方米。固定資產(chǎn)5.74億元，實驗室設備總價值2.87億元，建有全省唯一的生物安全三級實驗室、省菌（毒）種保藏庫。中心具備CNAS認可項目39類1480項，CMA資質(zhì)認定項目27大類1256項。獲批省級傳染病預防控制重點實驗室1個、省醫(yī)藥衛(wèi)生重點實驗室1個、省醫(yī)藥衛(wèi)生重點學科3個，省公共衛(wèi)生重點?？?0項（傳染病防控與公共衛(wèi)生應急領(lǐng)域7個，慢性病防控與健康促進領(lǐng)域3個）。
經(jīng)過努力，先后獲得“全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體”“全國疾病預防控制工作先進集體”“全國創(chuàng)先爭優(yōu)先進基層黨組織”“全國青年文明號”“中國青年五四獎章集體”“山東省抗擊新冠肺炎疫情先進集體”等100多項國家級和省（部）級殊榮，被省委省政府記集體一等功1次。近年來，省疾控中心全面深入學習貫徹黨的二十大精神，扎實推進主題教育，全力創(chuàng)建國家區(qū)域公共衛(wèi)生中心，高質(zhì)量推動全省疾病預防控制事業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。